Szyfrowanie szyfrem rijndael jest robione przez trzy funkcje:

void     rijndael_set_key(rijndael_ctx * kontekst, u_char * klucz, 
	int keylen, int mode);
void     rijndael_decrypt(rijndael_ctx * kontekst, u_char * wejscie, 
		u_char * wyjscie);
void     rijndael_encrypt(rijndael_ctx * kontekst, u_char * wejscie, 
		u_char * wyjscie);

rijndael_ctx to struktura w której jest pamietany stan 
algorytmu szyfrującego. Przed szyfrowaniem trzeba ją wypełnić
zależnie od klucza i trybu pracy (szyfrowanie lub deszyfrowanie). 
Następnie używa się procedurę rijndael_encrypt (albo 
rijndael_decrypt) do szyfrowania (odpowiednia deszyfrowania) kolejnych 
bloków danych -- jedno wywołanie szyfruje blok 16 bajtów.

Użycie: 
/* Wciągamy plik nagłówkowy */
#include "rijndael.h"
/* Deklarujemy strukturę zawierającą stan */
rijndael_ctx moj_kontekst;

/* Tu należałoby wypełnić klucz */
u_char klucz[16]={0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15};

/* Ustawiamy klucz szyfrowania */

    rijndael_set_key(&moj_kontekst, klucz, 128 /* 16*8 */, 1);

/* Szykujemy dane */
u_char wejscie[16];
u_char wyjscie[16];
.....

/* Szyfrowanie */
    rijndael_encrypt(&moj_kontekst, wejscie, wyjscie);